21 марта 1917 года является официальной датой основания музея. Он расположился в здании XVIII века, памятнике московского классицизма. В 1922 году там открылась выставка «Красная Москва», которую преобразовали в Историко-революционный музей Москвы, который с 1924 года стал называться Музеем революции СССР. С течением времени и расширением музейных коллекций и их тематики, музей стал самым крупным музеем по новейшей истории России.
Так, в 1998 году он стал Музеем современной истории России, соответственно, провели преобразование экспозиции. Сейчас он разделена на множество отделов, отражающих историю России начиная с середины XIX века и до последних событий в истории страны.
Отделы экспозиции поделены на залы, которые рассказывают о важнейших вехах истории. Вводный зал представляет вниманию историю России как субъект мировой истории. Другие залы рассказывают историю русско-японской войны, революций 1905 и 1917 годов, Гражданской войны в России, становлении Советского союза, периодах НЭПа и «военного коммунизма», Великой Отечественной войне и временах после нее, формировании Российской Федерации, и приоритетах нашей страны в настоящее время.
Музей имеет несколько филиалов в столице, среди которых музей-квартира Кржижановского, музей «Подпольная типография 1905-196 гг.» и музей «Пресня».