Открытие дома-музея состоялось 12 сентября 1992 года к 100-летнему юбилею поэтессы. Он расположился в доме на Борисоглебском переулке, в здании, где жила Марина Цветаева с 1914 года со своим мужем и дочерью. Первые годы жизни там были самыми счастливыми в жизни Цветаевой — они жили в мужем душа в душу, она регулярно печаталась «Северных записках», после рождения дочери буквально расцвела.
Но счастье ее было не долгим — революция сломала ее жизнь. Муж Цветаевой ушел в белогвардейскую армию и она не получала о нем известий несколько лет. Оставшись одна с двумя маленькими дочерьми, едва могла их прокормить и согреть. Она рубила стулья и шкафы на дрова, обменяла рояль на пуд муки, для экономии бумаги стихи писала на обоях. Но времена оказались слишком сложными — ей пришлось отдать дочерей в приют. В 1920 году умирает ее дочь Ирина, и 2 года спустя Цветаева со строй дочерью уезжает за границу. На этом заканчивается история жизни поэта в этом доме.
В советские дом стал обычно коммуналкой, в конце 1930-х годов встал вопрос о его сносе, но началась война и этот вопрос был отложен. В 1979 году уже было принято официально решение о сносе дома, отключили электричество, воду и выселили жильцов. Но дом спасла жившая в нем медик - фронтовик Надежда Ивановна Катаева - Лыткина, которая и стала Научным руководителем Дома-музея Марины Цветаевой.
Главными людьми обеспечившими создание и открытие Дома-музея Марины Цветаевой стали Анастасия Ивановна Цветаева, Дмитрий Сергеевич Лихачев и Раиса Максимовна Горбачева.
В настоящее время музей занимает полностью весь дом, а не только квартира Цветаевой. К сожалению, там хранится не так уж много подлинных вещей поэта и ее семьи. В большинстве своем это фотографии, книги и письма, принадлежавшие Марине Ивановне и ее мужу. Так же в Доме расположилась Научная библиотека, в которой хранятся книги о Цветаевой и ее семье на русском и многих европейских языках.