Основан в 1932 году. Основной деятельностью является анализ и охрана, а также воспроизводство редких или исчезающих видов растений. В состав сада входит дендрарий, оранжерея, лаборатория, теплица. С 1991 года, входит в состав Уфимского федерального исследовательского центра РАН. В саду более 5000 разновидностей флоры со всей планеты, 1800 цветов, 1500 видов деревьев и около 1000 тропических растений.