Образован Зоологический музей в 1832 году, за счёт отделения от фондов Кунсткамеры. Общая территория экспозиций занимает 6 000 кв.м. Предметы экспонатов насчитывают более 30000 тысяч. Коллекции занимают 3 этажа. На первом этаже размещены собрания самой большой группы животного мира - насекомых, которые включают в себя свыше 10000 тысяч экспонатов, начиная с древних и примитивных существ, среди которых есть ластоногие, синий кит (длиной в 27 м), китообразные, экспонаты, приобретённые Петром I, взятые из коллекций Кунсткамеры. Во втором зале находятся витрины с земноводными, рыбами, птицами, рептилиями. Здесь же располагаются практически 3000 видов беспозвоночных (кораллы, моллюски и другие). Третий этаж занимают млекопитающие. В левой стороне помещения устроились систематичные коллекции, в центральной и правой части поместились 89 биологических групп. Также в фонд музея входят экспонаты уже вымерших животных: коллекции мамонтов, среди них есть самый старый и крупный скелет мамонта, их детёныши, Стеллерова корова, тасманийский волк.