Минералогический музей находится в здании государственного университета, который уже двести лет располагается в сооружении 17 века, в здании «Двенадцати коллегий». В музее находятся старейшие собрания минералов, которые были собраны в коллекции ещё в 1785 году. В фонде музея 870 минеральных видов, 39 тысяч образцов. Коллекции архиепископа Н.Ярославского, Д.И. Менделеева и других представляют гордость для музея. Собрания минералов разделены по нескольким направлениям: систематическое минералогическое учебное, минеральных ассоциаций, драгоценных камней, экспонаты метеоритов, материалы минералогии России и ближайших стран. В музее, помимо экспозиций, ведётся научная и исследовательская деятельность по истории минералогии и минералогических музеев, их важность в решении всемирных проблем наук о Земле, здесь ведётся поиск развития естественнонаучных музеев мира. Все экспонаты — это уникальное руководство для исследований минеральных ископаемых Земли. Коллекции составляют часть российского и мирового исторического, культурного наследия.