В 70-е годы наблюдалось увеличение заболеваемости, инвалидности и смертности населения от болезней системы кровообращения. В связи с этим в 1980 году был основан научно-исследовательский институт кардиологии.
Инициатива создания НИИ в Ленинграде принадлежала заведующему кафедрой факультетской терапии 1-го ЛМИ им. акад. И.П. Павлова, профессору В.А. Алмазову. Под его руководством в 1983 году был создан первый отечественный портативный кардиомонитор «Инкарт», а в 1991 году Владимир Андреевич объединил научные и лечебные подразделения в научно-клинические отделения (НКО) для ускорения внедрения результатов научных разработок в клиническую практику.
В 2002 году институту было присвоено имя его основателя и первого директора В. А. Алмазова.
За многолетнюю история развития, совершенствования и расширения территорий «Центр Алмазова» стал ведущим российским центром. Гармоничное соединение фундаментальных и прикладных исследований в различных областях позволяет оказывать многопрофильную специализированную медицинскую помощь населению и непрерывную междисциплинарную подготовку научных и медицинских кадров.