Военнопленные шведы явились первыми лютеранами в Сибири. Они были захвачены в годы Северной войны со Швецией. Их использовали в качестве рабочей силы, когда строили Омскую крепость.
В середине XVIII столетия осуществлялось строительство сибирских пограничных линий. Данный факт способствовал увеличению количества военнослужащих-лютеран. Это и послужило условием к появлению в гарнизонах лютеранских приходов.
На восточной стороне крепостного плаца в 1790-1792 годах воздвигли лютеранскую кирху во имя Святой Екатерины. Она была построена из камня. Кирху строили на пожертвования военных. По замыслу архитектора была рассчитана на сто мест.
Здание представляло собой одноэтажное прямоугольное здание, построенное в стиле барокко. Лютеранская кирха является единственным храмом XVIII века в Омске, который сохранился до настоящего времени.
К зданию с восточной стороны пристроили полукруглую апсиду алтаря. На крепостную площадь выходит главный фасад здания лютеранской кирхи. Скругленные углы здания украшены пилястрами.
Ныне в здании лютеранской кирхи располагается музей УВД Омской области.