Музей природы является одним из старейших филиалов музейного объединения города Череповец. Музей был основан как музей местной природы имени А.И. Герцена в 1920 года. За более чем девяносто лет существования название и статус музея менялось множество раз. Но задача, поставленная перед музеем никогда не изменялась. В музее собирают, изучают и популяризуют природоведческие коллекции и знания о истории и развитии этого края.
В музее природы работает постоянная выставка, экспонаты которой рассказывают о природных особенностях Череповецкого района, о флоре и фауне местности и ее историческом развитии. Общее число экспонатов музея насчитывает около 30 тысяч экземпляров, которые объединяются в различные выставки.
В музее хранятся неповторимые энтомологическая, палеонтологическая, геологическая коллекции, коллекции минералов, гербариев, горных пород, которые представляют огромную научную ценность. Сотрудники музея регулярно проводят палеонтологические экспедиции, с помощью которых пополняют фонды музея ценным научным материалом.
Среди всего прочего, музей хранит большое собрание фотографий по природе России.
В музее постоянно проводят музейные уроки, экскурсии, а также работает детский лекторий.