Один из старейших мужских монастырей, Духов монастырь, был возведён в XII веке, а первое упоминание его в летописи датируется 1162 годом.
Когда-то это был крупный монастырь, теперь он уже является недействующим — был упразднён в 1920-х годах. Сейчас монастырь состоит из церкви Троицы, церкви Святого духа, зданий настоятельного и северного сестринского корпуса.
Монастырь поначалу был полностью деревянным, каменные строения на его территории стали появляться с середины XIV века. Первым каменным зданием был храм Святого духа, в XVI веке игумен Иона велел перестроить церковь Троицы. В следующем столетии монастырь, последовавший наказам общежительного устава архиепископа Макария, обзавёлся двухэтажной трапезной.
Здания монастыря страдали от набегов шведов и пожара 1685-го года. В XVIII веке монастырь стал женским, был перестроен, а в начале XX века закрыт и после Великой Отечественной войны отреставрирован — монастырь использовался во время войны как склад.
В наши дни в соборе Сошествия Святого Духа располагается архив.