Томский планетарий входит в тройку первых планетариев, которые стали действовать в Советском Союзе. История планетария начинается с 1947 года. В это время Государственный университет приобрёл трофейный оптический прибор "Планетарий". После войны город переживал трудности, но не смотря на это, для размещения планетария в 1947 году были найдены возможности. Решение учёного совета было такого: использовать прибор помимо учебного процесса студентов. Инструмент был отдан в областную организацию под названием «Знание», которой руководил А. Г. Савиных — знаменитый хирург. Увидев все прелести прибора, Андрей Григорьевич, порекомендовал, чтобы планетарий был более доступным. Аппарат поместили в сооружение краеведческого музея.
Конструкцией стал руководить А.И. Лихачёв, доктор наук. Открытие планетария прошло 8 сентября 1950 года. Первую лекцию читал А.И. Лихачёв, на ней присутствовали ведущие учёные, администрация города, администрация области. С 1980 по 1990 год планетарий являлся самостоятельным областным образованием культуры.