Церковь-школа была построена специально для детей работников железнодорожной станции Саратов-2. Церковь была основана в 1897 году, а уже 25 июля 1898 года здание освятил саратовский митрополит. Архитектором церкви-школы стал известный саратовский деятель Петр Митрофанович Зыбин. Постройка каменной новой церкви-школы была обращена к дню бракосочетания Императора Николая Александровича и императрицы Александры Федоровны. Средства на возведения церкви-школы были собраны из личных денежных средств работников Рязанско-Уральской магистрали. Престол в церкви был всего один и посвящен святителю Николаю. В Советское время церковь была закрыта. Со здания церкви были сняты кресты и купола, маковка, в общем все, что отличало церковь от обычного здания. Тем не менее, само здание было сохранено и позже в нем стало располагаться двухклассное училище. Несколько позже в здании находился спортивный зал местного профессионального училища. Не так давно бывшая церковь-школа была вновь освящена. 25 декабря 1997 года это здание было преобразовано в Свято-Никольский мужской монастырь.