Здание создано двумя итальянскими архитекторами братьями Бернардации. Расположение для будущей церкви выбиралось исходя из доступности до кладбища. Проект здания был готов к 1826 году. Но из-за нехватки рабочей силы и смерти одного из братьев, строительство храма завершилось только в 1856 году.
Церковь Лазаря Четверодневного послужила местои отпевания Михаила Юрьевича Лермонтова, место его первого захоронения так же располагается неподалеку.
Но просуществовал храм недолго. Уже в 1884 году из-за многочисленных недостатков грунта, здание дало трещину и его разобрали.
Храм решено было перестроить на другом месте. Вероятно архитектором этого проекта стал Василий Васильевич Графф. Фундамент был заложен в 1895 году. Строительство храма завершилось в 1902 году, а осветили помещение только в 1903 году. В храме хранится икона из Тарханы, подаренная бабушкой Лермонтова.