В Новотроицке есть железнодорожная станция и железнодорожный вокзал. Станция работает круглые сутки. Вокзал содержит в себе кресла, кассы, а также систему звукового оповещения и камеры для хранения багажа. На вокзале имеется бюро информации. Сама же станция оборудована небольшой крытой платформой, с которой осуществляется посадка пассажиров в поезда, следующие до Екатеринбурга, Оренбурга, Челябинска, Орска, а также Москвы и Адлера.
Здание железнодорожного вокзала расположено в северо-восточной части города, в паре метров от станции «Новотроицк». Рядом с ним можно найти столовую, ларьки, в которых продается, как печатная продукция, так выпечка и продукты питания. Кроме этого, неподалеку находится городская гостиница, а перед самим вокзалом памятник Ленину. При желании от железнодорожной станции можно сесть на автобус, с помощью которого можно доехать, как до центральных районов города, так и до любой его окраины, в том числе и до автовокзала.