В селе Манжерок (республика Алтай) нет собственного аэропорта. Самый близкий аэропорт находится недалеко от города Горно-Алтайск. Аэропорт "Горно-Алтайск" возобновил свое функционирование в 2010 году после реконструкции, взлетно-посадочная полоса была расширена и удлинена. Благодаря модернизации, у аэропорта появилась возможность работать круглогодично, а, следовательно, пропускная способность аэропорта увеличилась в два раза. В летние месяцы аэропорт пользуется особенно большой популярностью, и его загруженность достигает 100%.