Первое упоминание этого города уносит нас в 1317 год к Никоновской летописи. Клин был частью Тверского княжества. Он был городом-крепостью, с оборонительным рвом, валом и хорошо укреплёнными стенами, так как этот город являлся форпостом в войне Тверского и Московского княжеств.
За свою богатую историю город Клин нередко переходил из рук в руки, а в периоды нашествия татаро-монгол неоднократно разорялся, как и все остальные города. Через некоторое время за него начали войну Московское и Тверское княжества.
Так в 1409 году был набег татаро-монгол под руководством Едигея, этот город был разгравлен и разорён. А через семьдесят три года этот город отошёл к Москве по приказу Ивана III Васильевича. После входа в состав Московского княжества город перестал быть военно-стратегическим пунктом, так как с западной стороны были гораздо более сильные города-укрепления. Но Клин не забросили, он стал большим центром торговли и различных ремёсел. Большинство клиновчан стали заниматься извозом и почтовым делом.
В 1569-ом году этот город получил серьёзные страдания из-за опричнины. Огромные потери понесли живописные клинские леса. Также есть сведения, что основные строения Московского кремля были возведены из клинского леса.
А через 3 года Иван IV завешал этот город своему сыну. Позднее он стал вотчиной Романовых.
В 1617 году город пережил осаду поляков. В 1702 году город получил официально статус «почтового яма». Жители этого города обслуживали огромное количество проезжающих людей. В городе появилось огромное количество торговых лавок, гостиниц для приезжих, склады с продуктами и многое другое. Из-за того, что город занимался обслуживанием проезжающих, он постепенно вытянулся вдоль тракта.
В 1781 году он официально стал называться городом и получил собственный герб. Герб этого города был поделен на две части, наверху изображён герб Москвы, а внизу почтальон, который скачет с рожком. Этот герб символизирует нахождение города Клин на важной дороге, которая соединяет два города-столицы. Но через одно столетие герб изменился. На новом гербе был изображён серебряный щит, на котором нарисован почтальон в рубашке, шляпе и в плаще. Щит заканчивается короной в виде башни с тремя зубцами. За щитом нарисованы два золотых моста, которые соединяет Александровская лента. Серебряная башня является символом уездного города. А два молота символизируют развитую промышленность, ведь к концу девятнадцатого века этот город был одним из двенадцати наиболее развитых городов России.
Согласно некоторым данным статистики, к 1883 году в городе располагалось около 300 различных производств.
В 1784 году был представлен план застройки города.
В 1785-ом году Клин стал уездным городом Московской губернии.
Через этот город прошла одна из самых первых железных дорог на территории России, в 1851-ом году. Это сказалось на количестве ямских перевозок, они сократились и большая часть города была вынуждена заниматься ткачеством и изготовлением различных платков и прочего, но это и поспособствовало развитию промышленности. Город постепенно стал забываться и загнивать. Сместился его центр на Соборную площадь, где были торговые ряды, гостиницы и прочее.
Заводские работники этого города принимали участие в стачечном движении 1905 года. А в конце 1941 года (с 23 ноября до 15 декабря) находился в оккупации немецко-фашистских войск в ходе битвы за Москву, получил серьёзные повреждения и восстанавливался согласно новому плану.
А 28 апреля 2016 года город получил почётное звание «Населённого пункта воинской доблести».