Музей был создан на базе научно-исследовательского института в области рыбного хозяйства в 1922 году. Посетители имеют возможность познакомиться с обитателями Азовского и Черного морей. Экскурсоводы увлеченно рассказывают о видах красной рыбы, обитающей в Черном море, многие виды которых более 40 лет разводятся искусственно, в том числе для улова в промышленном масштабе.
Экзотические морские обитатели расположились на первом этаже. Сотрудники музея, проводя много времени в экспедициях по морям и океанам планеты, постоянно пополняют коллекцию. Акулы, наводящие своей агрессивностью страх на всех, оказавшихся в поле зрения, представлены в музее несколькими видами. Особый восторг вызывает акула-молот, не менее известный людоед, чем белая. Кораллы, обитающие в теплых морях, поражают яркой тропической расцветкой.
Новая часть музея Югниро, под которую обустраивается третий этаж здания, представит гостям морских птиц, а также некоторые доисторические экспонаты - кости животных, некогда обитавших на Керченском полуострове, отпечатки рыб, возраст которых по приблизительным подсчетам, более 10 миллионов лет.