Здание собора было возведено в 1930-1933 годах. Проектировал сооружение архитектор Артур Киктон. Собор предназначался для лютеранской евангелической общины Кенигсберга. Среди всех кирх города постройка имеет особенности: двубашенная колокольня для католических храмов, круглая модель основания постройки, обозначающая вечность, на фасаде изображён крупный крест. Здание выдержано в стиле древних восточных форм храмового зодчества. Внутреннее убранство сооружения было разделено колоннами на три нефа. Спустя время, к кирхе было возведено строение для духовенства и собраний общины.
В период войны здание было повреждено. В 50- годах здесь прошла реконструкция: новые перекрытия, изменения в форме кровли, пристройка к кирхе здания хозяйственного применения. С 1989 года сооружение было отдано в распоряжение Русской Православной Церкви. Свой первоначальный внешний и внутренний вид здание приобрело в 1991-1994 годах. Здесь проходят систематичные церковные богослужения. В 2006 году прошло освящение собора Христа Святейшим Патриархом.