Музей-аквариум был открыт 2 декабря 2005 года и его открытие приурочено к 60-летию Хабаровского филиала Тихоокеанского научно-исследовательского рыбохозяйственного центра.
За годы своего существования музей-аквариум успел стать не только визитной карточкой института, но и всего города в целом. Музей каждый год посещают 10-15 тысяч человек. У этого культурного объекта существует своя система скидок, по которой сироты и дошкольники посещают музей-аквариум бесплатно.
В экспозиции представлена живая коллекция из рыб, число видов которых больше 90 штук. Все эти рыбы обитают в главной реке города Хабаровска — Амуре.
Гостям музея наиболее интересны небольшие виды рыб, которых можно легко встретить в Амуре. Большинство из этих рыб до сих пор остаются неизвестными для некоторых жителей города. Именно поэтому музей-аквариум Рыбы Амура представляет собой незаменимую культурную ценность для хабаровчан и гостей города.
Но, к сожалению, система финансирования рыбохозяйственной науки была изменена в 2009 году и возникла большая проблема с содержанием музея. Чтобы помочь Амурским рыбкам достаточно просто прийти в музей.