В начале 90-х годов система арбитражных судов была полностью реформирована. Сначала в 1991 году был опубликован Закон №1543 РСФСР «Об арбитражном суде» от 04.07.91, преобразовавший Госарбитраж в арбитражные суды, затем в 1995 году была опубликован новый Закон, определивший работу этих ведомств.
Именно в такую революционную эпоху начал свою работу Арбитражный суд Хабаровского края. Он, как и другие суды, принадлежит к первому уровню и поэтому рассматривает все дела в первой инстанции. Порядок работы суда регламентирован российским законодательством, в частности, ст. З6 ФКЗ «Об арбитражных судах в РФ» от 28 апреля 1995 г.
Сотрудники аппарата не только занимаются рассмотрением арбитражных дел и апелляционных жалоб: также они анализируют судебную статистику, изучают современную юридическую практику, помогают федеральным судебным органам совершенствовать российское законодательство и вносить необходимые поправки.
Арбитражный суд Хабаровского края действует в составе председателя, заместителей председателя, судей и председателей судебных составов. На сегодняшний момент суд возглавляет Софрина Зоя Федоровна, заслуженный юрист Российской федерации и опытный судья.