Город Гусь-Хрустальный появился благодаря началу деятельности на этой территории фабрики по производству хрусталя, которая более 150 лет находилась в собственности знаменитого купеческого рода Мальцовых.
Основателем династии был уроженец Чернигова Богдан Мальцов, а производством хрусталя начал заниматься его правнук Василий Мальцов, после смерти которого семейное дело перешло в руки его сыновей Акима и Александра.
Братья приобрели под Можайском село Новое и построили там хрустальный завод, а в 1750 году решили его поделить поровну. Александр основал новое предприятие в Трубчевском уезде, а Аким решил перевезти свою долю в урочище Шиворово, расположенное на реке Гусь. Именно на этом месте и был заложен поселок, впоследствии ставший известным, как Гусь-Хрустальный.
В 1759 году Аким Мальцов пустил в строй еще один завод по выпуску оконного стекла. После его кончины делом династии стал заведовать законный наследник Иван Мальцов, а в 1811 году он отписал все свои предприятия брату Сергею. Тот через пять лет установил недалеко от хрустальной фабрики церковь Иоакима и Анны. Именно с этого момента поселок при заводе стал селом под названием Гусь.
После кончины Сергея Мальцова все его заводы и фабрики перешли к сыну, видному российскому дипломату Ивану Мальцову, по своей работе часто посещающему Европу. Побывав в Чехии, он стал интересоваться производством «богемского хрусталя», в котором не использовались примеси из металла. Переняв данную технологию, Иван Мальцов вводит ее в действие на своих фабриках. В результате уменьшения затрат и чудесного внешнего вида хрусталя новая продукция становится популярной по всей России.
Кроме преобразований на своих предприятиях Мальцов занимается строительством и благоустройством поселка. Под его чутким руководством были построены и начали свою работу училище, аптека и больница. Кроме того, дипломат и предприниматель жертвует деньги на благотворительную деятельность. В это же время в поселке были построены сорок каменных домов, количество которых за несколько лет выросло в десять раз. В связи с ростом производства и благоустройством поселка выросла численность его населения с 3,2 тысячи в 1859 году до 8 тысяч в 1886 году.
Иван Мальцов скончался в 1880 году в Швейцарии. Все его предприятия были унаследованы племянником, сыном его сестры Юрием Нечаевым, который после этого сменил фамилию на Нечаев-Мальцов. Он управлял огромным состоянием своего дяди в течение тридцати лет и активно продолжал его меценатскую деятельность. В конце XIX века Гусь-Хрустальный был признан одним из самых перспективных центров развития промышленного производства во Владимирской губернии.
После Октябрьской революции населенному пункту был присвоен статус города, а через десять лет он стал районным центром. С 1931 года Гусь-Хрустальный входит в состав Ивановской области.
Во время Великой Отечественной войны на территории города функционировали пять госпиталей, а в 1941 году жители Гусь-Хрустального создали комитет по обороне и отряд ополчения. Все городские предприятия перешли на «оборонные рельсы». На хрустальном заводе был налажен выпуск термометров, фляжек, термосов и другой продукции.
После войны завод по выпуску хрусталя стал ведущим предприятием этой отрасли в СССР.
В конце 2011 года хрустальный завод закрыли в связи с огромными убытками и долгами. Ровно через два года предприятие снова начало выпускать свою традиционную продукцию. Это было связано с запуском четвертого цеха, главной специализацией которого был выпуск цветного хрусталя.