Эта церковь строилась как монастырь. Является одним из древнейших культовых армянских сооружений на земле Крыма. Наличие в ней хачкара XI века, что в переводе означает «крест-камень», подтверждает время ее создания. Хачкары - это художественные символы армянского народа, устанавливаемые согласно обычаям в честь каких- то знаменательных событий либо для увековечивания памяти погибших.
Церковь одновременно красива и подчеркнуто проста, какой и должна быть по мнению армян. Четыре мощных столба, соединенных стрельчатыми арками, стоят недалеко от здания церкви – в 19 веке это был вход в нее.
Во время пожара 1888 года церковь очень сильно пострадала. Благодаря усилиям знаменитого мариниста, армянина по происхождению И.К. Айвазовского, был проведен ремонт и реконструкция здания. Церковь была знаковой в судьбе художника: здесь его крестили, венчали и отпевали тоже здесь. Двор церкви согласно желанию Айвазовского стал его последним земным пристанищем. Он пришел на эту землю простым смертным и оставил бессмертную память о себе.
Итальянским скульптором был создан белый мраморный саркофаг-надгробие и установлен на могиле художника в 1903году.