Строительство собора началось в 2003 году. За 2 года был возведен храм и хозяйственные корпуса, внутри расположились: библиотека, столовая, конференц-зал, магазин и несколько подсобных помещений. Собор был освящен в 2006. В храме хранятся частички мощей священномучеников и главная святыня Дальнего Востока - икона Пресвятой Богородицы.
Храм считается одним из самых красивых в области, его посещают тысячи людей, не только Биробиджана, но и приезжие с других регионов страны. Здесь ежедневно проводятся богослужения, отмечаются религиозные праздники, православные чтения.